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André QUINTANAR

Ingénieur en recherche et développement
Biologie Moléculaire, Instrumentation et Bioinformatique


Objectif

Recherche et développement dans le domaine de la biologie pour utiliser au mieux mes compétences et mes qualités.

Expérience professionnelle

Depuis 04/2020:
Responsable développement logiciel et Responsable qualification chez BforCure, Montreuil, France [http://www.bforcure.com]

03/2019 - 04/2020:

Chef de projet logiciel chez Sebia, Lisses, France [http://www.sebia.com]

Chef de projet pour la nouvelle version de Phoresis, utilisée pour piloter les instruments Capillarys, récolter et analyser les données

02/2008 - 03/2019:
Chef de projet intégration système chez Bio-Rad, Marnes-la-coquette, France [http://www.bio-rad.fr]

- Conception et mise au point d'une plateforme automatisée iQ-Check Prep pour la préparation d'échantillon (extraction d'ADN) et de réactifs de PCR pour la gamme de trousses iQ-Check. Plus de 70 instruments déployés dans le monde à ce jour
- Développement logiciel et chef de projet logiciel pour de nombreuses applications: iQ-Check Analysis, Opticon Monitor et CFX Manager IDE
- Co-auteur sur le fascicule de documentation FD V03-112: "Produits alimentaires - Qualification des thermocycleurs"
- Support client sur de nombreux aspects (logiciel, matériel, biochimie)

09/2005 - 01/2008:
Consultant décisionnel chez Elites Consulting, Clichy, France.

Chef de projet maîtrise d'oeuvre et maîtrise d'ouvrage, rédaction de cahiers de charges, développement et maintien de logiciels et de bases de données

04/2003 - 09/2005:
Ingénieur développement informatique chez Computer Engineering, Paris, France. [http://www.computer-engineering.fr]

Développement et maintien du logiciel BLOC pour la gestion informatique du bloc opératoire
Formation, assistance et avant-vente sur le logiciel BLOC

01/2001 - 06/2002:
Ingénieur d'Etude, Recherche et Développement chez Molecular Dynamics, Sunnyvale, CA, USA.

Mise au point et intégration système sur le MegaBACE (séquenceur automatique à électrophorèse multicapillaire) :
– comparaison des différents composants (paramètres d’injection, matrices, réactifs, lasers, “basecallers”) avec des systèmes concurrents et analyse des améliorations potentielles (techniques, prix) pour les plates-formes futures
– contrôle qualité en production du nouveau MegaBACE 4000 (384 séquences simultanées)
– supervision d'un groupe de 2 personnes pendant la phase finale du projet

Intégration système sur la future plate-forme LWS/LIMS version 1.0. Responsable de l'intégration des instruments (séquenceurs, microarrays) au sein de la plate-forme et définition du cahier des charges pour les futures versions 1.1 et 2.0

Développement et maintien (en interne) d’outils informatiques pour l'analyse automatique des séquences. Participation à la définition, à la mise au point et au test final du logiciel commercial ‘Sequencing Diagnostics 1.0’ issu de l’un de ces programmes

Contrôle qualité pour le département informatique

01/1998 - 06/2000 :
‘Visiting Scientist’ chez Megabase Research Products, Lincoln, NE, USA.

Conception, construction et mise au point d'un thermocycleur de PCR extrêmement rapide U.S. Patent No. 6,472,186

Responsable de la section hématologie : mise au point d'une technique rapide (moins de 20 minutes) pour le génotypage plaquettaire et d'une nouvelle méthode de PCR directe à partir de sang total

Aide à la mise au point d'une nouvelle technique brevetée (DNA Methyltransferase Genotyping) pour le diagnostic très rapide (< 20 minutes) de mutations génétiques

09/1993 - 10/1997 :
Technicien de recherche à l'Institut National de la Transfusion Sanguine, Paris, France dans le laboratoire d'Immunologie Plaquettaire. [http://www.ints.fr]

Mise au point, en collaboration avec Pharmacia (maintenant GE Healthcare), d'une nouvelle technique de SSCP fluorescente, utilisant un séquenceur automatique (ALFexpress) pour l'électrophorèse et l'analyse des produits

Utilisation de cette technique pour l'analyse de Thrombopénies Néonatales inexpliquées et pour la recherche de mutations génétiques chez des patients atteint de Thrombasténie de Glanzmann

Domaines de compétence

Biologie Moléculaire et Immunologie :
  • Réaction de polymérisation en chaîne (PCR)
  • Séquençage automatique sur de nombreuses plates-formes (ALFexpress, MegaBACE, ABI PRISM 3700 DNA analyzer)
  • Séquençage manuel, analyses RFLP et SSCP et clonage bactérien
  • Techniques ELISA et MAIPA, sérologie de routine (HIV, Hépatites A, B et C, …)
  • Techniques de chromatographie

Instrumentation :
  • Conception et réalisation grâce au logiciel LabVIEW de chez National Instrument
  • Programmation (en Basic) du processeur Intel 8051
  • Maîtrise de l'électronique modulaire

Informatique :
  • Programmation (Python, Windev, C, C++, Javascript, PHP, Basic et Visual Basic)
  • Très bonnes connaissances du langage SQL et des techniques associées à la création de bases de données. Bonnes connaissances Oracle, Sybase, SQL Server et Access
  • Utilisation de nombreux logiciels (Microsoft Office, manipulation graphique, …) aussi bien sur compatibles PC que sur Macintosh et création de nombreux sites web
  • Très bonne maîtrise de différents systèmes d'exploitation (Windows, MacOS et Linux)

Publications (sélection)

Beck, K.L., Haiminen, N., Chambliss, D. et al. Monitoring the microbiome for food safety and quality using deep shotgun sequencing. npj Sci Food 5, 3 (2021)

Haiminen, N., Edlund, S., Chambliss, D. et al. Food authentication from shotgun sequencing reads with an application on high protein powders. npj Sci Food 3, 24 (2019)

Lopez, O.J., Quintanar, A., Padhye, N.V. and Nelson, M. Genotyping of DNA using sequence-specific methyltransferases followed by immunochemical detection. Journal of immunoassay & immunochemistry 24(1):11-28 (2003)

Padhye, N.V., Nelson, R.M., Quintanar, A., Viljoen, H.J., Whitney, S.E., Shoemaker, D., and Henchal, E.A. High-Speed Amplification of Bacillus anthracis DNA Using a Pressurized Helium-CO2 Gas Thermocycler. Genetic Engineering News 22(11):42-43 (2002)

Quintanar, A., Jallu, V., Legros, Y. and Kaplan, C. Human Platelet Antigen genotyping using fluorescent SSCP technique with an automatic sequencer. British Journal of Haematology 103:437-444 (1998)

Morel-Kopp, M.C., Quintanar, A. and Kaplan, C. Detection of specific platelets antibodies by a new ELISA method based on a MAIPA modification. Platelets 5:285 (1994)

Brevets

A rapid immunochemical process for measuring thiopurine methyltransferase. Padhye, N. V., Quintanar, A. and Nelson, R. M. (2003) U.S. Patent No. 6,946,258

A gas jet process and apparatus for high-speed amplification of DNA. Whitney, S.E., Nelson, R.M., Quintanar, A., Viljoen, H.J. and Padhye, N.V. (2002) PCT Patent WO 2004/042086 A1

A high speed process and apparatus for amplifying DNA. Quintanar, A. and Nelson, R.M. (1999) U.S. Patent No. 6,472,186

Etudes & Langues

2003 D.E.S.S. Informatique et applications aux sciences de la vie - Université René Descartes Paris 5
1997 Diplôme de l'école option Biologie Moléculaire (niveau Maîtrise) - Ecole Pratique des Hautes Etudes, Paris
1994 Spécialisation option Immunologie/Biologie Moléculaire - Ecole Supérieure Techniques Biologie Appliquées, Paris
1993 Brevet de Technicien Supérieur Biochimiste - Ecole Nationale de Chimie Physique Biologie, Paris
1991 Baccalauréat scientifique Série D (Biologie) - Lycée Newton, Clichy

Français : langue maternelle
Anglais : bilingue (980 au TOEIC)
Allemand : notions (niveau Terminale)

Mais encore...

Service National (10/1994 – 07/1995) dans le Service de Santé des Armées à l'Hôpital Dominique Larrey, Versailles (77) : technicien en sérologie [dépistages HIV et hépatites A, B et C par l'utilisation de kits ELISA]

Diplômé du Brevet d'Aptitude aux Fonctions d'Animateur (B.A.F.A) : encadrements de nombreux centres de vacances

Lecture (romans), cinéma, musique (pratique du piano), voyages.